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方 雷

文章来源:澳门十大正规平台网站 发布时候: 2019-09-01阅读次数: 685

硕士研讨生导师简介

姓名

方雷

研讨标的目的:

卵白质组学与大数据

接洽体例

Email: njfanglei@doremond.com

学术兼职:

美国质谱学会会员、中国细胞生物学会会员

江苏省细胞与发育生物学会理事

Scientific ReportsJournal of Proteome Research审稿专家

国度天然科学基金函审专家

小我简介

教导履历:

 2001/09–2006/12, 南京大学, 生化与份子生物学, 博士

 1997/09–2001/06, 山东大学, 生物学与生物技术, 学士

科研与学术任务履历:

2019/09-至今,南京大学化学与生物医药立异研讨院,双聘PI

 2015/03-至今,澳门十大正规平台网站 ,副传授

 2011/10-2015/02,美国纽约大学Langone医学中间,助理研讨员

 2007/03-2011/09,美国加州大学Irvine分校,博士后

讲授:

掌管主讲澳门十大正规平台网站 8年制和“5+3本科生课程《细胞生物学》、科教融会课程《卵白质组学驱动的肿瘤精准医学》和公选课《生物组学与人类疾病》,掌管主讲研讨生课程《生物医学仪器阐发》等课程。





科研环境简介:

作为首要实现人到场了“微生物基因工程可溶性抒发及产品后加工新技术”名目,取得了江苏省科技前进一等奖(排名第三)和国度技术发现二等奖(排名第四)。今朝在Nature CommunicationsEMBO JJ Pathol.J Biol Chem.和卵白质组学顶尖期刊Mol Cell ProteomicsJ Proteome Res.共颁发SCI论文40余篇,此中颁发于J Proteome Res.的第一作者论文被Faculty1000收录并保举。掌管国度天然科学基金面上名目两项和青年基金名目一项,掌管江苏省天然科学基金面上名目一项,到场国度天然科学基金重点名目和戎行后勤开放研讨名目各一项。自20157月返国任务以来,在澳门十大正规平台网站 重新搭建了不变高效的卵白质质谱平台,并慢慢成立了多种疾病卵白质组学研讨的技术手腕和方式,普遍展开基于疾病卵白质组学的精准医学研讨。

研讨标的目的:

  1. 基于卵白质组学的精准医学研讨: 挑选和判定具备临床诊断和医治靶点代价的疾病卵白质标记物。

  2. 药物或代谢小份子体内靶点卵白的判定和生物学功效研讨。

  3. 卵白质组学的研讨战略和方式开辟: 包含卵白质复合物的高效亲和纯化和判定(AP-MS);卵白质翻译后润色位点(PTMs磷酸化乙酰化泛素化和异戊二烯化润色等)的判定和生物学功效研讨;操纵卵白质化学交联技术研讨特定卵白复合物连系卵白收集的静态变更(QTAX)。



近五年来代表性论文

  1. Yue Zhao, Meng-Fei Zhao, Shan Jiang, Jing Wu, Jia Liu, Xian-Wen Yuan, Di Shen, Jing-Zi Zhang, Nan Zhou, Jian He, Lei Fang*, Xi-Tai Sun*, Bin Xue*, Chao-Jun Li*. Liver governs adipose remodelling via extracellular vesicles in response to lipid overload. Nature Communications. 2020 Feb 5;11(1):719. doi: 10.1038/s41467-020-14450-6. * Co-corresponding author. IF 11.9,学科群一流。

  2. Xiao Jiang, Xinyi Wang, Xianming Ding,MengjieDu, Boran Li, Xialian Weng, Jingzi Zhang, Lin Li, Rui Tian, Qi Zhu, She Chen, Liang Wang, Wei Liu, Lei Fang(*), Dante Neculai(*), Qiming Sun(*). FAM134B oligomerization drives endoplasmic reticulum membrane scission for ER-phagy. EMBO J.2020 Jan 13:e102608. doi: 10.15252/embj.2019102608. * Co-corresponding author. IF 11.2,南大A区、1区。

  3. Jingzi Zhang, Neng Tang, Yinjuan Zhao, Ruoyu Zhao, Xiao Fu, Dandan Zhao, Yue Zhao, Lan Huang, Chaojun Li, Yudong Qiu*, Bin Xue*, Lei Fang*. Global Phosphoproteomic Analysis Reveals Significant Metabolic Reprogramming in the Termination of Liver Regeneration in Mice. J Proteome Res. 2020 Feb 27. doi: 10.1021/acs.jproteome.0c00028. 南大B, 1区。

  4. Zhang J, Zhao R, Yu C, Bryant CLN, Wu K, Liu Z, Ding Y, Zhao Y, Xue B, Pan ZQ, Li C, Huang L, Fang L. IKK-mediated regulation of the COP9 signalosome via phosphorylation of CSN5. J Proteome Res. 2020 Jan 17. doi: 10.1021/acs.jproteome.9b00626. 南大B, 1区。

  5. Niikura, Y.(#), Fang, L.(#), Kitagawa, R., Li, P., Xi, Y., You, J., Guo, Y., Kitagawa, K. Mass Spectrometry Analysis to Identify Ubiquitylation of EYFP-tagged CENP-A (EYFP-CENP-A). J. Vis. Exp. 2020 Jun 10;(160). doi: 10.3791/61138.

  6. Cao Y, Ding W, Zhang J, Gao Q, Yang H, Cao W, Wang Z, Fang L(*), Du R(*). Significant down-regulation of urea cycle generates clinically relevant proteomic signature in hepatocellular carcinoma patients with macrovascular invasion. J Proteome Res. 2019 May 3;18(5):2032-2044. * Co-corresponding author. 南大B, 1区。

  7. Liu JJiang SZhao Y, Sun QZhang JShen DWu JShen NFu XSun XYu DChen JHe JShi TDing YFang L(*)Xue B(*)Li C(*). Geranylgeranyl diphosphate synthase (GGPPS) regulates non-alcoholic fatty liver disease (NAFLD)-fibrosis progression by determining hepatic glucose/fatty acid preference under high-fat diet conditions. J Pathol. 2018 Nov;246(3):277-288.* Co-corresponding author. 南大A区、1区。

  8. Wu Y, Zhang J, Fang L(*), Lee HC(*), Zhao YJ(*). A cytosolic chaperone complex controls folding and degradation of type III CD38. J Biol Chem. 2019 Mar 15;294(11):4247-4258. * Co-corresponding author. 南大A区。

  9. Fang LChen DYu CLi HBrocato JHuang LJin C.Mechanisms Underlying Acrolein-mediated Inhibition of Chromatin Assembly. Mol Cell Biol. 2016 Nov 14; 36(23):2995-3008. 南大B,1区。

  10. Brocato J (#)Fang L(#) Chervona YChen DKiok KSun HTseng HCXu DShamy MJin CCosta M.Arsenic induces polyadenylation of canonical histone mRNA by downregulating stem-loop binding protein gene expression.J. Biol. Chem.201428946): 31751-31764# Co-first author. 南大A区。


承当科研名目

1.国度天然科学基金面上名目,32071256,“VCP/p97-20S卵白酶体调控肝癌复发的份子机制及其临床操纵”,2021/01-2024/1258万,在研,掌管。

2.国度天然科学基金面上名目,31770838,“GGPP连系FBP1调控糖脂代谢到场肝细胞癌产生成长的机制研讨”,2018/01-2021/1260万,在研,掌管。

3. 国度天然科学基金青年基金名目,31500664,“操纵质谱表征TNF-α引诱的COP9旌旗灯号小体感化卵白收集变更”,2016/01-2018/1220万,已结题,掌管。

4. 江苏省天然科学基金面上名目,BK20171338,“GGPP连系CPT1alpha调控肝脏脂质代谢的机制研讨”,2017/07-2020/0610万,在研,掌管。

5. 国度天然科学基金重点名目,31530046,“卵白质异戊二烯化调控低级卵泡/次级卵泡转换的感化和机制研讨”,2016/01-2020/12280万,在研,到场。

6. 2020年度戎行后勤开放研讨名目,“人体严寒顺应的评价和晋升关键技术研讨”,2020/05-2023/12275万,在研,主干。

7. 与南京诺唯赞生物科技有限公司技术开辟横向协作名目,“基于二代测序和卵白质组学的基因工程抗体开辟”,2018/01-2020/1240万,在研,掌管。

8. 掌管南京大学中心高校根基费教导部立异团队名目、首创与穿插名目、国际协作交换名目、技术立异基金名目和人材引进启动基金名目等近10项,算计跨越200万。




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